Como parte de su misión de proteger los ecosistemas funcionales de las islas de Puerto Rico y asegurar los servicios esenciales que estos proveen, el Fideicomiso de Conservación de Puerto Rico ha enfocado sus estrategias de adquisición de terrenos y manejo de ecosistemas a través de un acercamiento regional, basado en las principales cuencas hidrográficas de Puerto Rico. De esta manera se han establecido y clasificado cinco regiones distintas, según los puntos cardinales: norte, San Juan-central, este, sur, y oeste. Las áreas naturales protegidas del Fideicomiso de Conservación son manejadas y supervisadas de acuerdo a esta red regional. Como parte de este acercamiento, cada Región tiene un área natural protegida designada como su cede operacional:

• Región 1 Norte: Reserva natural Hacienda La Esperanza
• Región 2 San Juan-Central: Casa  Ramón Power y Giralt

• Región 3 Este: Reserva natural Cabezas de San Juan

• Región 4 Sur: Área Natural Protegida Hacienda Buena Vista

• Región 5 Oeste: Área Natural Protegida Hacienda Buena Vista

• Esta red regional le da el apoyo necesario a los objetivos de manejo y política pública dirigidos a reducir la fragmentación de ecosistemas y a asegurar el mantenimiento a largo plazo de los procesos ecológicos naturales y la biodiversidad a una escala regional.